** BIOMINDS POSTER DAY **

Biominds – AmGen Co. Research for Undergraduate Program

El sábado 21 de marzo de 2009 todo s los Biomentes tuvimos la oportunidad de presentar los resultados obtenidos en cada una de las investigaciones de las cuales cada uno de los estudiantes participa. Fue una experiencia sumamente enriquecedora ya que no solo pudimos demostrar nuestros conocimientos en nuestra área de estudio e investigación sino también de compartir con otros compañeros participantes del mismo programa que a lo mejor nunca habíamos visto o nunca habíamos tenido la oportunidad de hablar e intercambiar ideas. Este día fue uno de esos días en los cuales le doy gracias a el programa Biominds de abrirme las puertas por no solo aprender de la investigación, sino de conocer gente y darme cuenta que la vida de un científico tarta de eso, exponer resultados y analizar como [podemos incrementar la eficiencia de metodología a través de la idea de otro científicos. Presentar un “research poster” no solo fue una muy buena experiencia, sino que al compararla con la presentación del poster en la que participe en Orlando Florida (ABRCMS) me di sentí bien tranquila y segura, ya que estaba en mi casita Puerto Rico.

 

MI PROYECTO SE TITULO:

WATER QUALITY IN THE IRRIGATION SYSTEM FROM LAJAS VALLEY: PRESENCE AND QUANTIFICATION OF ENTEROCOCCI AND COLIFORMS BACTERIA

(1) Sheila M. González, (2) Miguel Muñoz and (3) Myrna Alameda

(1) Department of Biology, University of Puerto Rico, Mayagüez, PR

(2) Agricultural Experimental Station UPRM, Lajas Valley PR

(3) Department of Agricultural Sciences, University of Puerto Rico, Mayagüez, PR

 

Tuve la oportunidad de evaluar tres poster de tres diferentes estudiantes de las categorías de Bioingeniería (D-2 y D-5) y Microbiología (F-2). A continuación un breve resumen de las evaluaciones de los tres poster evaluados por mí:

 D-2   Proyecto: “Plasma Electrolytic Oxidation Used for Hydroxyapatite

  Thin Film Formation on Ti-6AI-4V and γ-TiAl Alloys”

Autores: Ana Mosquera (Biomente), Laura Lara y Paul Sundaram- UPRM

 Las preguntas que le hice acerca de su proyecto eran: Cual era el propósito de la investigación y porque utilizan titanio para los implantes en hueso. La estudiante demostró conocimiento sobre el tema y contesto dichas preguntas muy bien, haciendo referencia a los datos de su afiche y a la data recopilada. El afiche tenía resumen, introducción, metodologia y resultados. El resumen era conciso y la introducción contenía conocimiento del tema y planteaba de forma clara el problema y la hipótesis del mismo. La discusión y los resultados proveían la información necesaria para evaluar el progreso del proyecto. De forma general el afiche estuvo mu bien creado y  la letra que utilizaron fue una fácil de leer. A continuación un breve resumen de la contestación a las preguntas hechas a la BIOMENTE Ana Mosquera:

 

Este proyecto es importante para los implantes de cadera ya que utilizan titanio para hacer los mismos. Me explicaron que el uso de titanio como material para implantes ortopédicos  es importante ya que han encontrado que  por sus propiedad fisicas y mecánicas, el cuerpo lo acepta facilitando así la óseo-integración del mismo. Según la literatura, el titanio “normal” tiene poca adherencia ya que es algo fino y es por ello que en este proyecto están intentando diseñar un tratamiento donde puedan utilizar el titanio γ-TiAl Alloys con un bioactivador llamado hidroxiapatita dado por la formula molecular Ca10 (PO4)6(OH)2  el cual ayudaría a que se regenere y se sane rápidamente, reduciendo las continuas cirugías para cambiar el material de los implantes.

 

D-5   Proyecto: “Growth and Biocompatibility Studies of Osteoblast

Cells Grown in Stainless Steel and  Ti-6AI-4V Alloys”

Autores: Yamilette Lopez (Biomente), Pricila Santiago, Nanette Diffoot

y Paul Sundaram- UPRM

Las preguntas que le hice acerca de su proyecto eran: Cual era el propósito de la investigación y si ya lo habían puesto aprueba en seres humanos (in vivo). La estudiante demostró conocimiento sobre el tema y contesto dichas preguntas muy bien, haciendo referencia a los datos de su afiche y a la data recopilada. El afiche tenía resumen, introducción, metodología y resultados. El resumen era conciso y la introducción contenía conocimiento del tema y planteaba de forma clara el problema y la hipótesis del mismo. La discusión y los resultados proveían la información necesaria para evaluar el progreso del proyecto. De forma general el afiche estuvo mu bien creado y  la letra que utilizaron fue una fácil de leer. A continuación un breve resumen de la contestación a las preguntas hechas a la BIOMENTE Yamilette López:

 Ti-6AI-4V  es un metal que resiste corrosión dentro del cuerpo humano y ocurre oseo-integracion sin ninguna “consecuencia”, los osteoblastos adhiriéndose al stainless steel sin ningún problema. Me explicaron que el propósito principal de este proyecto era observar crecimiento de las células llamadas osteoblastos (tomadas de un fetos) en material Stainless Steel vs. en Ti-6AI-4V  y evaluar su biocompatibilidad de los osteoblastos humanos en cada uno de eso materiales. Este procedimiento se ha hecho solo in vitro (con células), pero todavía no se ha hecho in vivo.

          

F-2   Proyecto: “Profiling of culturable Bacteria Associated to

the Boer Goat Upper”

Autores: Sirena Montalvo (Biomente) y Arturo Massol- UPRM

Las preguntas que le hice acerca de su proyecto eran: Cual era el propósito de la investigación y que microorganismos se encontró en las muestras obtenidas de las ubres de la cabra. La estudiante demostró conocimiento sobre el tema y contesto dichas preguntas muy bien, haciendo referencia a los datos de su afiche y a la data recopilada. El afiche tenía resumen, introducción, metodología y resultados. El resumen era conciso y la introducción contenía conocimiento del tema y planteaba de forma clara el problema y la hipótesis del mismo. La discusión y los resultados proveían la información necesaria para evaluar el progreso del proyecto. De forma general el afiche estuvo mu bien creado y  la letra que utilizaron fue una fácil de leer. A continuación un breve resumen de la contestación a las preguntas hechas a la BIOMENTE Sirena Montalvo:

  Las mastitis es una infección en la ubre de muchos animales rumiantes. Para estudiar dicho fenómeno, este proyecto se dio a la tarea de muestrear la ubre de las vacas y ver la diversidad de microorganismo allí presentes para entonces a su vez evaluar cuan propenso estaba ese rumiante a padecer de mastitis ya que esta enfermedad es un factor importante en la venta y consumo de la leche en el mercado. Se obtuvieron de la muestras bacterias como lactobacillos, staphylococos, entre otras bacterias… Dado que el mercado de la leche de vaca pudiera afectarse por el efecto de la mastitis en la calidad de la leche, estudiar este efecto en cabras podría ser de igual importancia.

 

 

AVANZANDO…

Agronomy and Soils Department: Soil and Water Microbiology Laboratory and the Agricultural Experimental Station in Lajas Valley UPRM

WATER QUALITY IN THE IRRIGATION SYSTEM FROM LAJAS VALLEY: PRESENCE AND QUANTIFICATION OF ENTEROCOCCI AND COLIFORMS BACTERIA

Puedo decir que el proyecto en el que he estado trabajando este semestre ha sido muy interesante. He aprendido nuevas técnicas de identificación de cierto grupo bacteriano llamado coliformes (incluyendo E.coli) y enterococcos. Hasta el momento hemos muestreado el sistema de riego del Valle de Lajas una vez ya que el muestreo será mensual. Clasificaría el progreso del proyecto en de un rango de 1-5, como 4 ya que hemos logrado completar el 80% de los objetivos propuestos para esta parte del proyecto. Cabe mencionar que dicho proyecto no solo estado en enfocado en el área biológica, sino también química. Esta parte química del proyecto la corren otros profesores y estudiantes. Como parte del programa Biominds y la labor de la profesora Myrna Alameda junto a mi en este proyecto, estamos colaborando en detectar presencia y cuantificar las bacterias antes mencionadas. Se supone se muestrearan 11 estaciones, pero en este primer muestreo se muestrearon 10 ya que la estación 1 estaba siendo utilizada para otro proyecto en el momento. De esas 10 estaciones todas excedían el máximo valor de coliformes permitibles (max. por la EPA 200NMP/100ml), en las estaciones 2,3,4,5,9,1, excedían el máximo valor de E.coli permitible en agua (max. por EPA 123 NMP/100ml) y en las estaciones 2,3,4,5,6,8,9 excedían el valor máximo permitible para enterococcos sp. (max. 33NMP/100ml). Seguiremos muestreando para ver la tendencia de este comportamiento de la presencia de estos microorganismos en el sistema de riego.

IRRIGATION SYSTEM LAJAS VALLEY- PUEBLO EN AMARILLO DEL MAPA DE PUERTO RICO INDICA EL PUEBLO DE LAJAS

ABSTRACT

 

WATER QUALITY IN THE IRRIGATION SYSTEM FROM LAJAS VALLEY: PRESENCE AND QUANTIFICATION OF ENTEROCOCCI AND COLIFORMS BACTERIA

(1) Sheila M. González, (2) Miguel Muñoz and (3) Myrna Alameda

(1) Department of Biology, University of Puerto Rico, Mayagüez, PR

(2) Agricultural Experimental Station UPRM, Lajas Valley PR

(3) Department of Agricultural Sciences, University of Puerto Rico, Mayagüez, PR

 

Lajas Valley in an agricultural reserve where  farmers work in forage production, beef and dairy cattle, ruminants animals, fruits and vegetables. In this reserve, the irrigation system plays an important role providing drainage to different farms around it. Water quality in this irrigation system is very important. Farms working in animal husbandry, may be the main factor affecting the quality of runoff water. Enterococcus spp. and coliforms from animal feces can be drag by runoff water contaminating the irrigation system   E .coli and  Enterococcus spp. are potential indicators of fecal contamination in water sources. This microorganism can affect the health of the people that consume vegetables, fruits and other products that are irrigated with this water. To study the presence of this microorganism, water samples were taken from eleven stations divided in west (Guánica Lagoon discharging at Guánica Bay) and east (Cartagena Lagoon discharging at Boquerón Bay). Colilert and Enterolert were the methods used   to quantify these microorganisms. Preliminary results indicate that the most probable number (MPN/100mL) for Enterococcus is higher than the quantity of 35 mpn/100mL permitted in seven of the ten stations sampled. The MPN for coliforms exceeded the 200 MPN/100mL in five of the ten stations sampled. Four of the ten stations exceeded the standard quality numbers for both coliforms and enterococci counts. Keep tracking this irrigation channel is important to performed final analysis about the quality and safety use of water in the Lajas Valley and growing plants for food. To confirm the identities of these microorganisms, DNA extraction, amplification and further sequence of the 16S rDNA can be performed in the future.

 

 

 

 

 

 

Trabajando en Nuevo Proyecto Enero 09-Mayo 09

Cuantificación, Aislamiento e Identificación  de Enterobacterias y Coliformes en el sistema de drenaje del Valle de Lajas

           Biominds es un programa de investigación en el cual se el brinda al estudiante la oportunidad de desarrollarse en su área de estudio y es pro ello que este semestre comienzo un nuevo proyecto sin dejar atrás los conocimientos adquiridos en mi investigación anterior. Trabaje en el laboratorio de Micología Medica del Depto. de Biología desde Enero 2008- Diciembre 2008 con el proyecto titulado : “Ecología, Caracterización y Distribución de Cryptococcus neoformans/gatti” en el cual tuve la oportunidad de estudiar la ecología de este microorganismo (levadura), que características poseía para ser un agente candidato a patógeno (dependiendo su especie) y como la distribución geográfica en Puerto Rico podría afectar la salud de cierta población. Siendo la microbiología clínica un área de mi interés pues mi primer proyecto fue el ya mencionado y el proyecto en el cual estaré trabajando este semestre Enero 2009-Mayo 2009  tiene de cierta manera un “link” en cuanto a la microbiología clínica se refiere y se titula: “Cuantificación, Aislamiento e Identificación  de Enterobacterias y Coliformes en el sistema de drenaje del Valle de Lajas” proyecto dirigido en el Depto. de Ciencias Agrícolas. En este tendré la oportunidad de cuantificar la cantidad de enterobacterias y coliformes en ese sistema de agua, aislar e identificar dichos microorganismos. Si encontráramos coliformes ya eso es un indicador de contaminación fecal en el agua.

A continuación describiré de forma breve lo que son enterococos y coliformes para que tengan una idea mas clara con que tipo de microorganismos estaré trabajando y como este proyecto podría relacionarse, en cuanto a la salud humana se refiere, con mi proyecto anterior:

 

 

 

 

                                     Enterococos: son cocos g(+) que se presentan generalmente en forma de diplococos y son anaerobias facultativas (pueden sobrevivir aunque haya decadencia de oxigeno). Se caracterizan por ser bacterias que pudieran causar infección en el tracto urinario, endocarditis, meningitis, entre otras complicaciones. Su actuación patógena proviene de la resistencia a ciertos antibióticos como son los antibiótico de origen beta-lactamicos.

  

 

                                                 Coliformes: se le conocen también como enterobacterias y son bacilos g(-). Otras características que los define es que son oxidasa (-) y son anaerobias facultativas.

                 Al final del semestre espero haber logrado cuantificar la cantidad de enterobacterias y coliformes en ese sistema de drenaje y como la cantidad de los mismos podrían afectar la de las personas que consumen productos regados con dicha agua, hacer un análisis estaditico (análisis de varianza) de dichas poblaciones, aislar e identificar con técnicas moleculares, aplicando también la bioinformática los microorganismos recuperados; haber aprendido a aplicar y utilizar nuevas técnicas de conteo de microorganismos (en este caso enterococos y coliformes). 

El trabajo de este semestre en relación al proyecto de lso semstre anterioires tiene una base rganismo podrían afectar la calidad de salud del ser humano cuando son expuesto a agentes patógenos. En proyecto no los estaré trabajando en la ecología en las que se encuentras los enterococos y los coliformes sino la cantidad de estos en dicho cuerpo de agua del Valle de Lajas y como podrían afectar a las personas que consumen productos y cosechas que son regados y nutridos con dicha agua. Se quiere analizar esta agua ya que al utilizarse para el riego de siembras y estando este en contacto con animales y ganado la excreta de los mismos podrían contaminar significativamente esa agua que se utiliza para riego teniendo impacto a corto o largo plazo en la salud de las personas consumidoras.

Las técnicas que se planean implantar para identificar las enterobacterias y los coliformes son  el Enterolert y Colilert respectivamente. Además luego de cuantificar, aislaremos, identificaremos (mediante técnicas moleculares) y analizaremo (mediante procesos estaditicos) los microorganismos totales recolectados, los enteroccos y coliformes aislados  de dichas muestras de agua del sistema de drenaje del Valle de Lajas.

 

Enterolert

       

 

Colilert

      

 

 

 

 

 

 

Finalizando con el Proyecto del Semestre

Cryptococcus neoformans/gatti

El semestre pasado tuve la oportunidad de continuar con el proyecto ya empezado por otros compañeros estudiantes, analizando así la ecología de Cryptococcus neoformans/gatti en diferentes puntos alrededor de puerto Rico. Nos dimos a la tarea de tomar muestras en diferentes pueblos y este semestre se me fue asignado junto con mi partner de laboratorio Jeny  los pueblos de Yabucoa, Guayama, Patillas y Arroyo. Al comienzo de este semestre comenzamos muestriando los pueblos de Guayama y Arroyo de cuales se tomaron alrededor de 50 muestras entre ambos pueblos tanto de detrito de arboles como de muestras tomadas de heridas de arboles. De esas 50 muestras 49 fueron negativos y encontramos 1 positivo el cual consideramos un candidato para Cryptocccous neoformans. Este fue encontrado en un árbol de almendro de unas muestras recolectadas del pueblo de Arroyo. El tipo de muestras que dio positiva fue de muestras tomada de heridas de la corteza de dicho árbol. Para los pueblos de Yabucoa y Patillas se tuvo que esperar un poco mas ya que el mal tiempo en este semestre en todo Puerto Rico causo estragos en el área sur por lo que dichos pueblos fueron afectados seriamente. Hace 15 días atrás se muestreó Patillas y el muestreó fue algo difícil ya que todavía el pueblo no se encuentra totalmente restaurado de las fuertes lluvias ocurridas. De estas muestras tomadas de este pueblo que fueron alrededor de 25 muestras (24 de heridas de arboles y 1 de detrito), se aisló uno para verificar si podría ser C. neoformans o no y otros dos medios con crecimiento se dejaron crecer un poco mas para observar si al ponerlos a incubar por mas tiempo se podría ver crecimiento de este. Al momento queda muestrear el pueblo de Yabucoa el cual se llevara a cabo este próximo fin de semana del 29 de noviembre al 30 de noviembre de 2008. Cualquier otro resultado lo dejare saber luego en nuevos blog entries.

Las consideraciones que tomamos para que podamos pensar que podría ser C. neoformans son las siguientes: la colonia de la levadura debe crecer color marrón en medio NSA, lo que significa que dicho microorganismo tiene la enzima fenoloxidasa la cual ayuda en la producción de melanina lo que produce dicho color. Al producir melanina protege a la levadura de los rayos ultravioletas y de ambientes oxidantes. Puede que se pregunten también porque los tipos de muestras que tomo en los muestreos son heridas de arboles o de muestras de detritos? bueno la contestación es sencilla, esta levadura al tener la enzima fenoloxidasa la cual es familia de las lacasa tiene la habilidad de descomponer lignina que es un compuesto primordial en la madera, o sea, que si se encuentra en muestras de detritos degrada lignina y por consiguiente es un candidato a C. neoformans. Por otro lado, se hacen observaciones microscópicas en las cuales se tiñe la muestra de la colonia con tinta Ink para observar si tiene capsula. Si se observa capsula entonces no acercamos mas a que sea nuestra levadura. Para terminar de confirmar nuestros desconocidos le hacemos pruebas de ureasa y si la urea cambia de color de amarillo a anaranjado o rosa, significa que dicho agente tiene la enzima ureasa y que tenga esta enzima implica que tien la habilidad de hidrolizar urea para convertirla en amonia por lo que la urea cambia de un estado acido a uno básico o alcalino.

Próximas consideraciones para estudiar a C. neoformans en mas detalles serán las siguientes: seguiremos tomando muestras alrededor de todo Puerto Rico y a las muestras positivas de colonias aisladas de otros pueblos se le llevarán a cabo análisis molecular ( extracción de DNA… etc)  

ABRCMS 2008 en Orlando Florida (Annual Biomedical Research Conference for Minority Students)

ABRCMS 2008 en Orlando Florida

Del 5 de noviembre de 2008 al domingo 9 de noviembre de 2008 participe en la conferencia ABRCMS ( Annual Biomedical Research Confernece for Minority Students) celebrada en Orlando, Florida. En esta conferencia tuve la oportunidad de presentar mi trabajo de investigación titulado : “Distribution and characterization of Cryptococcus neoformans/gattii in Puerto Rico’’ ( se incluye como anejo a esta carta el abstract del mismo). Fue una experiencia muy enriquecedora que ayudo en la colaboración de nuevas experiencias investigativas y académicas, además de que tuve la oportunidad de compartir con profesores y personas importantes en mi área de estudio de Microbiología. Tuve la oportunidad de conocer al pasado presidente de ASM (American Society of Microbiology) Clifford W. Houston y  que además es el Chaiperson de ABRCMS. Por otro lado también tuve la oportunidad de conocer a la actual presidenta de ASM ya que la misma fue una de las juezas que evaluó mi poster.

En adición tuve la oportunidad de participar de varias conferencias como lo fueron: Presentation techniques: How to make an effective poster and oral presentation (importante para nuestro desarrollo académico e investigativo), Evolution of Emerging Disease Viruses ( donde hablaron mas bien del virus de la fiebre aviar), How bacteria talk to each other (en mi opinión esta fue una de las mejores conferencias ya que al ser la microbiología mi area me gusto mucho porque además de que entendí el tema también aporto mucho mas a los conocimientos que tengo de cómo las bacterias se comunican las nas con las otras), From Sponges to sources: Differences between Undergraduate and Graduate school, Graduate Application Process I, Managing Stress and Time: Prioritizing to maximize One’s time and effort, Writing a Sucessful Personal Statement, entre otras muchas conferencias que me sirvieron de mucho para organizar mis pensamientos para poder llevar a cabo el proceso de aplicación a escuela graduada.

No solo las conferencias me sirvieron de mucho, también les fui de apoyo a mis compañeros del programa BioMinds ya que fui a las secciones de presentación de poster de cada uno de ellos. Luego de haber hecho nuestro trabajo, el ultimo día cuando mencionaban los ganadores me sentí muy orgullosa de que Alejandro hubiera ganado premio en su categoría en Química.

 

Agradecemos al programa BioMinds que a su vez me sirvió de soporte al sentirme en la responsabilidad de representar nuestro programa con dignidad lo cual me ayudo tanto a mi como a mis compañeros en el crecimiento y desarrollo profesional de cada uno de los integrantes que participaron del mismo.

 

LUEGO DE CONFERENCIAS Y PRESENTACIONES… LOS PUERTORRIQUE~OS CELEBRAMOS POR NUESTROS TRIUNFOS YA QUE PUERTO RICO OBTUVO ALREDEDOR DE 17 PREMIOS… ORGULLO BORICUA…

 

 

Getting Results!!!

PROGRESO INVESTIGATIVO

En cuanto a mi progeso con la investigacion pudiera clasificarlo como un 4 ya que hemos logrado mi partner de laboratorio y yo completar el 80% de nuestras metas propuestas hasta el momento. Para esta proxima semana ya estaremos procesando e incubando las ultimas muestras del semestres referentes a los pueblos de Patillas y Yabucoa. Actualmente de las muestras tomadas de los pueblos de Guayama y Arroyo, pudimos aislar una colonia con caracteristicas fisicas identicas a las de Cryptococcus neoformans, esta muestra fue tomada de un arbol de Almendro del pueblo de Arroyo. Estamos en proceso de llevarle a cabo pruebas bioquimicas para identificar dicha levadura como C.neoformans y para verificar si es de la variedad gatti tendremos que crecerla en otro medio especifico para esa especie.

Hemos logrado mucho avance en comparacion a muchos otros compa~eros de BioMinds. Al aislar y purificar este posible candidato a C.neofomans, podremos trabajar con ellos mas a fondo para el proximo semestre. Tenemos mucho planes para el proximo semestre con esas muestras de Arroyo  y otras muestras tomadas de otros pueblos de otros estudiantes anteriores, los cuales comenzaron dicho proyecto.

En lo que queda de semestre espero poder aislar C.neofrmans/gatti de los pueblos que me quedan por muestriar este semestre, por lo que si lo logro lo sabran en la proxima entrada en el BioBlog. Espero sigan al tanto de mi investigacion que puedo asegurar pronto tendre muy buenos resultados.

BioMinds en Progreso!!

CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS

Este semestre ha sido un semestre en el cual la actividad cientifica en mi investigacion a fluido de forma muy activa. A mi grupo de trabajo y a mi se nos asignaron los pueblos a los cuales habia que hacer el muestreo de rutina para el aislamineto de la levadura Cryptococcus neoformans y los pueblos que se me fueron asignados en conjunto con mi partner del laboratorio fueron: Guayama, Arroyo, Patilla y Yabucoa. Hasta el momento hemos muestriado Arroyo y Guayama recopilando alrededor de 50 muestras de arboles y dentritos de los mismo, tanto de : almendros, mango y flamboyan que son los que predominan en esa area.

De las tecnicas aprendidas durante el transcurso de el programa de investigacion de BioMinds tanto de este semestre como del semestre anterior, las que he aplicado hasta el momento es la actividad de muestreo, de cultivo y aislamiento de especimenes candidatos a la levadura de interes. Hasta el momento he aislado una levadura con caracteristicas fisicas similares a Cryptococcus neoformans y se obtuvo de un arbol de almendro del pueblo de Arroyo, pero todavia falta hacerle ciertas pruebas para confirmar que sea nuestra levadura y que no sea alguna otra. Por otro lado estamos en proceso de tratar el detrito recopilado de los pueblos muestriados, por lo que pronto estaremos trabajando con el mismo para luego sembara en medio y analizar y observar crecimiento.

Utilizando una escala del 1 al 5 podria decir que la investigacion a corrido a nivel 4, por lo que ha habido bastante progreso y se han cumplido un poquito mas de 80% de los objetivos propuestos de forma general. Cabe mencionar que hasta el momento no hemos tenidos dificultades de forma directa, la unica dificultad que encontramos cuando muestriamos fue que el clima estaba inestable por lo que si llovia el muestreo tenia que cancelarse ya que no se podia continuar con el muestreo, pero aparte de eso todo esta corriendo muy bien gracias al mentor y al apoyo de mi partner de investigacion.

Summer Research Experience 2008 and Future Goals for BioMinds Project

Summer Research Experience 2008

Este pasado verano hice Summer Research en la UF en Gainesville Florida ”LOS GATORS!!!, hehhee” en el Departamento de Microbiologia y Ciencias Celulares. Participamos del programa alrededor de 10 estudiantes subgraduados provenientes de distintas universidades alrededor de los Estados Unidos y YO LA UNICA LATINA Y PUERTORRIQUE~!!! UJUP!!! heheehehe. Bueno de los 10 estudiantes que participamos del mismo solo se el nombre de 8 de ellos y de las personas encargadas de la coordinacion del mismo. Entre los estudiantes que participamos fueron Brian (Pittsburg), Patrick (Rochester), Megan (Virginia Tech), Alex (Purdue Indiana), April (UF), Nikki (Arizona), Sarah y Mary que eran gemelas (South Dakota) y SHEILA LA PUERTO RICAN DEL RECINTO UNIVERSITARIO DE MAYAGUEZ DE LA UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO… hehehhee la verdad es un orgullo!!. Entre los coordinadores puedo mencionar a los doctores Nemat Keyhani y Gurley , ademas de Brett Kirkland el estudiante graduado que ayudo con dicha coordinacion.

El titulo de mi proyecto fue: Cellular Basis of Seed Elargement in Arabidopssi tfl1 mutant y el objetivo del mismo era estudiar porque las semillas mutantes tfl1 (que era un mutante que afectaba el tranposte de proteinas a unas vacuolas que servian como almacen para ayudar en el crecimiento de los embriones de estas semillas) eran mas grandes que aquellas semillas wild-type.

De hecho quiero darle gracias al grupo del tecnico del lab de microscopia de la UF – Microbiology and Cell Science Department por darme un apoyo que nunca imagine iba a tener.

INVESTIGACION BIOMINDS

Este semestre tenemos como meta seguir muestriando alrededor de todo Puerto Rico incluyendo la isla Mona y el Bosque de Luquillo. Ademas incorporaremos a nuestro metodo de estudio tecnicas de aspecto molecular y genetico, pero todo dependera de las muestras que tomemos y los resultados de aspectos fisicos y bioquimicos que se obtengan de agentes aislados en los muestreos. Nuestro enfoque es seguir buscando aspectos importantes sobre la levadura patogena Cryptococcus neoformans y aspectos que sustenten con mucho mas fuerza, infromacion y descubrimientos ya publicados o en proceso de publicacion (Tesis: M.S. Yaliz Loperena). El semesre pasado trabajamos con muestreo, aislamiento, aspectos fisicos y pruebas bioquimcas para identificar colonias de dicha levadura; para poder llevar a cabo el proceso de investigacion de forma ordenada se mantendra el mismo proceso de muestreo…lo que cambiaria serian los lugares de muestreo. Todavia estamos en proceso de planificar especificamente los experimentos a llevarse a cabo pero estamos muy motivados a que al igual que el semestre pasado nuestro proyecto colabore significativamente al estudio de esta levadura y a su vez ayude al avance de nuestro proyecto.

Cryptococcus Neoformans

                                     

La ecología microbiana tiene un importante impacto al momento de trabajar con microorganismos, ya que según el ambiente donde se encuentren los mismo, estos se comportaran y adquirirán características peculiares que nos ayudan a abundar mas en su estudio y sobre sus funciones en el ambiente. En este caso estaremos estudiando el ecología del agente microbiano Cryptococcus neoformans. Cryptococcus neformans es un agente levaduriforme que posee capsula y por onsiguiente puede ocasionar enfermedades de tipo oportunistas y hasta sistemáticas según sea el caso. Hay varias variedades de Cryptococcus neoformans, entre estas se encuentra la variedad neoformans y la variedad grubii que afecta  a personas inmunocomprometidas y se ha asociado a personas que padecen del SIDA en los Estados Unidos. Por otro lado tenemos la variedad gatti que afecta a personas inmunocompetentes. Con  el fin de poder estudiar la ecología de Cryptococcus neoformans en  Puerto Rico, se tomaron muestras ambientales provenientes de arboles principalmente de eucalipto, mango, aguacate y almendro y detritos de los mismo para luego cultivarlos en medio NSA (Niger Seed Agar). Luego se encubaron y se observaron el crecimiento de la diversidad microbiana en dichas muestras, se identificaba las colonias características de Cryptococcus spp. y se aislaban. Al aislar colonia de Cryptococcus spp. le hacían las pruebas pertinentes para la identificación y estudio del mismo.

Resultados de Investigación Enero 08-Mayo 08: Experiencia- Estudio y Experimentación Futura

 Resultados de Investigación Enero 08-Mayo 08:

Experiencia- Estudio y Experimentación Futura

      La levadura patógena Cryptococcus neoformans/gatti fue estudiada muy a fondo este primer seemestre de investigación con dicho microorganismos. Con los resultados adquiridos de los pueblos muestriados de Cidra y Aguas Buenas, se recolectaron alrededor de 60 muestras ambientales entre muestras de detritos y muestras de heridas de árboles de muestreo. De esas 60 muestras recolectadas hubo 5 posibles candidatos para ser C. neoformans/gatti pero al aislarlas se observaron que eran hongos filamentoso y no lavaduriformes lo que nos indica que dichos microorganismos que eran posibles candidatos eran negativos y no eran C. neoformans, por lo que de 60 muestras recolectadas hubieron 0 recuperación de esta levadura. Para aplicar las técnicas que requiere la identificación de los mismo, tanto a mi como a mis compañeros del grupo se nos asignaron colonias de este micoroganismo que ya habian sido aisladas y a las misma les extrajimos DNA, le hicimos tinción negativa para observar su cápsula y experimentamos lo que fue identificar y aplicar las técnicas correpondientes para dicha caracterización. Se comenzaron a implicar técnicas moleculares pero todavia estamos en proceso de desarrollar dichos experimentos.

        Para mejorar la experimentación pensamos planificar para el próximos semestre estudiar su génetica y su biología molecular mas a fondo para entender de forma satisfactoria porque su patogenecidad, porque sus sntomas, porque afecta ciertos órganos, como este podría mutar y afectar de forma mas agresiva al ser humano… ademas de como distintas cepas pueden recombinarse para reproducir híbridos que podria ser de gran daño y de forma letal directa al ser humano.

       Como este microorganismo no ha sido muy estudiado en nuestra isla , nos daremos a la tarea de seguir estudiando el mismo y  adquirir estrategias y técnicas de prevención y orientación para aquellos que no saben cuan peligroso es adquirir una infección por este patógeno ya que no solo afecta a seres inmunocomprometidos, sino también a inmunocompetentes. Es por ello que le daremos continuidad a estudios que ya se han hecho en el recinto por la estudiante graduada Yaliz Loperena, Candidata a M.S.